Microorganismes marins et outils moléculaires MU5MRM29
Marine microorganisms and molecular tools
Parcours: Fonctionnement des Écosystèmes Marins et Changements Globaux
ECTS: 6
Responsable(s): C. SIX, N. SIMON
Lieu: Roscoff
Mots clefs:
- Microorganismes marins
- Outils moléculaires
- Diversité taxonomique
- Adaptation à la niche
- Interaction biotique
Description rapide:
- Connaissances précises des différents groupes de microorgansimes marins (eucaryotes, procaryotes, virus) : biodiversité , évolution et adaptations moléculaires, interactions, boucle microbienne, cycles biogéochimiques, quorum sensing.
- Méthodes de culture des microorganismes marins : isolement, purification, manipulation en conditions stériles, cytométrie de flux, suivis de croissance, etc.
- Technologies de pointe pour comprendre l’écologie des microorganismes marins : séquençage haut-débit, protéomique, métabolomique, techniques optiques, etc.
- Méthodes bioinformatiques de génomique comparative et métagénomique : exploration de données et bases de données génomiques pour répondre à des questions écologiques
Keywords:
- Marine microorganisms
- Molecular tools
- Taxonomic diversity
- Niche adaptation
- Biotic interaction
Quick description:
- Advanced knowledge of the different marine microorganisms (eukaryotes, prokaryotes & viruses): biodiversity, evolution & molecular adaptation, Interactions among marine microorganisms, Microbial loop, Biogeochemical cycles, Quorum sensing
- Culture methods of marine microorganisms: isolation, purification, manipulation under sterile conditions, flow cytometry, growth parametrization, etc.
- Initiation to advanced technology methods to understand marine microorganism ecology: High throughput sequencing, proteomic, metabolomic, optical techniques, etc.
- Bioinformatics methods of comparative genomics and metagenomics: exploring whole sequenced genomes and environmental sequence databases to answer ecological questions.